Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD1P29536 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD1P29536 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD1P29536 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMOD1P29536 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMOD1P29536 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMOD1P29536 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD1P29536 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMOD1P29536 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMOD1P29536 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LMOD1P29536 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMOD1P29536 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMOD1P29536 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMOD1P29536 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD1P29536 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
LMOD1P29536 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD1P29536 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LMOD1P29536 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms