Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNFRSF8P28908 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFRSF8P28908 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF8P28908 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF8P28908 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF8P28908 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms