Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RXRBP28702 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RXRBP28702 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RXRBP28702 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RXRBP28702 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RXRBP28702 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RXRBP28702 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RXRBP28702 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RXRBP28702 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RXRBP28702 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RXRBP28702 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RXRBP28702 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RXRBP28702 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RXRBP28702 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RXRBP28702 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RXRBP28702 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RXRBP28702 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RXRBP28702 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RXRBP28702 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RXRBP28702 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RXRBP28702 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RXRBP28702 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RXRBP28702 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RXRBP28702 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RXRBP28702 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RXRBP28702 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RXRBP28702 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RXRBP28702 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RXRBP28702 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RXRBP28702 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RXRBP28702 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RXRBP28702 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RXRBP28702 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RXRBP28702 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RXRBP28702 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RXRBP28702 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RXRBP28702 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RXRBP28702 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
RXRBP28702 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RXRBP28702 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RXRBP28702 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RXRBP28702 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RXRBP28702 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RXRBP28702 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RXRBP28702 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RXRBP28702 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RXRBP28702 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RXRBP28702 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RXRBP28702 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RXRBP28702 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RXRBP28702 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RXRBP28702 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RXRBP28702 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RXRBP28702 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RXRBP28702 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RXRBP28702 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RXRBP28702 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RXRBP28702 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RXRBP28702 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RXRBP28702 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RXRBP28702 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RXRBP28702 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RXRBP28702 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
RXRBP28702 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RXRBP28702 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RXRBP28702 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RXRBP28702 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RXRBP28702 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RXRBP28702 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RXRBP28702 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RXRBP28702 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RXRBP28702 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RXRBP28702 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RXRBP28702 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RXRBP28702 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RXRBP28702 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RXRBP28702 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RXRBP28702 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RXRBP28702 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
RXRBP28702 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RXRBP28702 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RXRBP28702 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RXRBP28702 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RXRBP28702 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RXRBP28702 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RXRBP28702 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RXRBP28702 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
RXRBP28702 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RXRBP28702 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RXRBP28702 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RXRBP28702 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RXRBP28702 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RXRBP28702 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RXRBP28702 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
RXRBP28702 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RXRBP28702 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RXRBP28702 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RXRBP28702 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RXRBP28702 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RXRBP28702 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms