Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SSFA2P28290 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SSFA2P28290 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SSFA2P28290 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SSFA2P28290 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SSFA2P28290 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SSFA2P28290 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SSFA2P28290 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SSFA2P28290 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SSFA2P28290 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SSFA2P28290 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSFA2P28290 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SSFA2P28290 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SSFA2P28290 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SSFA2P28290 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SSFA2P28290 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SSFA2P28290 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SSFA2P28290 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SSFA2P28290 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SSFA2P28290 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SSFA2P28290 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SSFA2P28290 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SSFA2P28290 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SSFA2P28290 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SSFA2P28290 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SSFA2P28290 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SSFA2P28290 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SSFA2P28290 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SSFA2P28290 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SSFA2P28290 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SSFA2P28290 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SSFA2P28290 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SSFA2P28290 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SSFA2P28290 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SSFA2P28290 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SSFA2P28290 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SSFA2P28290 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SSFA2P28290 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms