Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP1P23763 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAMP1P23763 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAMP1P23763 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAMP1P23763 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAMP1P23763 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms