Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRZ1P23471 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRZ1P23471 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRZ1P23471 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRZ1P23471 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRZ1P23471 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRZ1P23471 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRZ1P23471 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRZ1P23471 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRZ1P23471 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRZ1P23471 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRZ1P23471 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRZ1P23471 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRZ1P23471 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRZ1P23471 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRZ1P23471 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRZ1P23471 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRZ1P23471 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRZ1P23471 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRZ1P23471 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRZ1P23471 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRZ1P23471 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRZ1P23471 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRZ1P23471 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRZ1P23471 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRZ1P23471 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRZ1P23471 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRZ1P23471 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms