Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME2P23368 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME2P23368 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME2P23368 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME2P23368 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME2P23368 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME2P23368 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME2P23368 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME2P23368 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME2P23368 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME2P23368 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME2P23368 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME2P23368 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME2P23368 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME2P23368 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME2P23368 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME2P23368 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME2P23368 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME2P23368 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ME2P23368 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ME2P23368 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME2P23368 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME2P23368 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ME2P23368 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME2P23368 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME2P23368 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ME2P23368 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ME2P23368 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME2P23368 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME2P23368 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME2P23368 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME2P23368 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME2P23368 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME2P23368 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME2P23368 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME2P23368 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME2P23368 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME2P23368 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME2P23368 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME2P23368 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME2P23368 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME2P23368 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME2P23368 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ME2P23368 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME2P23368 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME2P23368 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME2P23368 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME2P23368 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME2P23368 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME2P23368 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME2P23368 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME2P23368 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME2P23368 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME2P23368 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME2P23368 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME2P23368 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME2P23368 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME2P23368 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME2P23368 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME2P23368 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME2P23368 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME2P23368 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME2P23368 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME2P23368 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME2P23368 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ME2P23368 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME2P23368 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ME2P23368 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME2P23368 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME2P23368 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME2P23368 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME2P23368 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME2P23368 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME2P23368 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME2P23368 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME2P23368 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME2P23368 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ME2P23368 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ME2P23368 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME2P23368 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME2P23368 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME2P23368 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME2P23368 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME2P23368 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME2P23368 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME2P23368 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME2P23368 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME2P23368 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME2P23368 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ME2P23368 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME2P23368 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME2P23368 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ME2P23368 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ME2P23368 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ME2P23368 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME2P23368 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME2P23368 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME2P23368 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME2P23368 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME2P23368 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms