Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ERBB3P21860 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ERBB3P21860 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERBB3P21860 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERBB3P21860 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ERBB3P21860 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERBB3P21860 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERBB3P21860 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERBB3P21860 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ERBB3P21860 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ERBB3P21860 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERBB3P21860 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ERBB3P21860 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms