Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZSCAN20P17040 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZSCAN20P17040 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ZSCAN20P17040 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZSCAN20P17040 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms