Protein–RNA interactions for Protein: P16581

SELE, E-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELEP16581 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELEP16581 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SELEP16581 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELEP16581 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELEP16581 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELEP16581 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELEP16581 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELEP16581 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELEP16581 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELEP16581 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELEP16581 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELEP16581 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELEP16581 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELEP16581 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELEP16581 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELEP16581 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELEP16581 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELEP16581 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELEP16581 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELEP16581 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELEP16581 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELEP16581 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELEP16581 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELEP16581 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SELEP16581 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELEP16581 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELEP16581 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELEP16581 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELEP16581 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELEP16581 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELEP16581 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELEP16581 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELEP16581 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELEP16581 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELEP16581 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELEP16581 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELEP16581 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELEP16581 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELEP16581 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELEP16581 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELEP16581 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SELEP16581 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELEP16581 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELEP16581 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SELEP16581 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELEP16581 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SELEP16581 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELEP16581 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELEP16581 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELEP16581 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELEP16581 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELEP16581 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELEP16581 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELEP16581 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELEP16581 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELEP16581 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELEP16581 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELEP16581 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELEP16581 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELEP16581 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELEP16581 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELEP16581 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELEP16581 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELEP16581 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SELEP16581 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SELEP16581 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELEP16581 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SELEP16581 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SELEP16581 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SELEP16581 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELEP16581 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELEP16581 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELEP16581 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELEP16581 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELEP16581 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELEP16581 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELEP16581 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELEP16581 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELEP16581 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELEP16581 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELEP16581 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELEP16581 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SELEP16581 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SELEP16581 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SELEP16581 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELEP16581 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELEP16581 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELEP16581 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELEP16581 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELEP16581 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELEP16581 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELEP16581 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELEP16581 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELEP16581 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELEP16581 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELEP16581 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELEP16581 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELEP16581 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELEP16581 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELEP16581 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173 ms