Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GATA1P15976 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GATA1P15976 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GATA1P15976 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GATA1P15976 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GATA1P15976 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATA1P15976 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATA1P15976 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATA1P15976 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATA1P15976 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATA1P15976 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATA1P15976 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATA1P15976 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GATA1P15976 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GATA1P15976 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GATA1P15976 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GATA1P15976 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GATA1P15976 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GATA1P15976 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATA1P15976 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATA1P15976 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA1P15976 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA1P15976 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA1P15976 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA1P15976 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATA1P15976 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA1P15976 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA1P15976 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA1P15976 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA1P15976 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA1P15976 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA1P15976 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA1P15976 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA1P15976 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA1P15976 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATA1P15976 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATA1P15976 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA1P15976 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA1P15976 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA1P15976 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA1P15976 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA1P15976 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA1P15976 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATA1P15976 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATA1P15976 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GATA1P15976 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATA1P15976 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATA1P15976 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GATA1P15976 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATA1P15976 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GATA1P15976 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GATA1P15976 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GATA1P15976 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GATA1P15976 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GATA1P15976 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GATA1P15976 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GATA1P15976 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GATA1P15976 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GATA1P15976 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GATA1P15976 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GATA1P15976 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GATA1P15976 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GATA1P15976 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GATA1P15976 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GATA1P15976 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GATA1P15976 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GATA1P15976 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GATA1P15976 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GATA1P15976 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATA1P15976 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATA1P15976 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATA1P15976 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATA1P15976 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATA1P15976 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GATA1P15976 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GATA1P15976 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GATA1P15976 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA1P15976 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA1P15976 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA1P15976 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA1P15976 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA1P15976 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA1P15976 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA1P15976 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA1P15976 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA1P15976 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA1P15976 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA1P15976 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA1P15976 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA1P15976 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA1P15976 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA1P15976 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA1P15976 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA1P15976 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA1P15976 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATA1P15976 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATA1P15976 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATA1P15976 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATA1P15976 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATA1P15976 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms