Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFHP12036 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NEFHP12036 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFHP12036 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFHP12036 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFHP12036 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFHP12036 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFHP12036 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFHP12036 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFHP12036 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFHP12036 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFHP12036 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFHP12036 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFHP12036 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFHP12036 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFHP12036 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFHP12036 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFHP12036 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFHP12036 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFHP12036 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFHP12036 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFHP12036 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFHP12036 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFHP12036 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFHP12036 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFHP12036 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFHP12036 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFHP12036 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFHP12036 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFHP12036 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFHP12036 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFHP12036 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFHP12036 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFHP12036 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFHP12036 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFHP12036 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFHP12036 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFHP12036 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFHP12036 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFHP12036 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEFHP12036 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEFHP12036 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFHP12036 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFHP12036 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFHP12036 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFHP12036 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFHP12036 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEFHP12036 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFHP12036 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFHP12036 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEFHP12036 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEFHP12036 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEFHP12036 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFHP12036 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFHP12036 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFHP12036 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFHP12036 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFHP12036 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFHP12036 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFHP12036 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEFHP12036 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFHP12036 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFHP12036 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFHP12036 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFHP12036 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFHP12036 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFHP12036 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFHP12036 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFHP12036 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFHP12036 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFHP12036 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFHP12036 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFHP12036 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFHP12036 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFHP12036 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFHP12036 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFHP12036 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFHP12036 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFHP12036 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFHP12036 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFHP12036 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFHP12036 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFHP12036 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFHP12036 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFHP12036 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFHP12036 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NEFHP12036 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFHP12036 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFHP12036 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFHP12036 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFHP12036 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFHP12036 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFHP12036 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFHP12036 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFHP12036 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFHP12036 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFHP12036 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFHP12036 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFHP12036 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFHP12036 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms