Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTHFD1P11586 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MTHFD1P11586 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MTHFD1P11586 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTHFD1P11586 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms