Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DMDP11532 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DMDP11532 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DMDP11532 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DMDP11532 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DMDP11532 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DMDP11532 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DMDP11532 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DMDP11532 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DMDP11532 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DMDP11532 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DMDP11532 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DMDP11532 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DMDP11532 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DMDP11532 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DMDP11532 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DMDP11532 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DMDP11532 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DMDP11532 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DMDP11532 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DMDP11532 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DMDP11532 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DMDP11532 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DMDP11532 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
DMDP11532 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DMDP11532 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DMDP11532 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DMDP11532 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DMDP11532 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DMDP11532 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DMDP11532 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DMDP11532 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DMDP11532 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DMDP11532 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DMDP11532 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DMDP11532 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DMDP11532 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DMDP11532 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DMDP11532 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DMDP11532 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DMDP11532 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DMDP11532 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DMDP11532 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DMDP11532 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DMDP11532 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DMDP11532 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DMDP11532 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DMDP11532 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DMDP11532 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DMDP11532 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DMDP11532 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DMDP11532 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DMDP11532 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DMDP11532 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DMDP11532 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DMDP11532 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DMDP11532 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DMDP11532 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DMDP11532 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DMDP11532 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DMDP11532 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DMDP11532 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DMDP11532 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DMDP11532 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DMDP11532 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DMDP11532 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DMDP11532 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DMDP11532 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DMDP11532 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DMDP11532 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DMDP11532 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DMDP11532 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DMDP11532 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DMDP11532 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DMDP11532 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DMDP11532 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DMDP11532 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DMDP11532 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DMDP11532 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DMDP11532 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DMDP11532 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DMDP11532 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DMDP11532 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DMDP11532 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DMDP11532 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DMDP11532 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DMDP11532 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DMDP11532 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DMDP11532 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DMDP11532 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DMDP11532 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DMDP11532 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DMDP11532 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DMDP11532 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DMDP11532 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DMDP11532 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DMDP11532 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DMDP11532 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DMDP11532 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DMDP11532 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms