Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4AP11441 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBL4AP11441 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
UBL4AP11441 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBL4AP11441 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms