Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM13P0DJ93 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM13P0DJ93 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM13P0DJ93 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms