Protein–RNA interactions for Protein: P0CG33

GOLGA6D, Golgin subfamily A member 6D, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6DP0CG33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6DP0CG33 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6DP0CG33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6DP0CG33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6DP0CG33 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6DP0CG33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6DP0CG33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6DP0CG33 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6DP0CG33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6DP0CG33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6DP0CG33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GOLGA6DP0CG33 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6DP0CG33 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6DP0CG33 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms