Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKHD1P08F94 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKHD1P08F94 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKHD1P08F94 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKHD1P08F94 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms