Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCKP06239 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCKP06239 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCKP06239 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCKP06239 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCKP06239 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCKP06239 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCKP06239 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCKP06239 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCKP06239 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCKP06239 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCKP06239 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCKP06239 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LCKP06239 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCKP06239 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LCKP06239 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCKP06239 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCKP06239 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCKP06239 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCKP06239 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCKP06239 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCKP06239 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCKP06239 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LCKP06239 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCKP06239 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCKP06239 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCKP06239 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCKP06239 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCKP06239 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCKP06239 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCKP06239 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCKP06239 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCKP06239 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCKP06239 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LCKP06239 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCKP06239 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LCKP06239 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCKP06239 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCKP06239 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCKP06239 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCKP06239 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCKP06239 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCKP06239 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCKP06239 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCKP06239 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
LCKP06239 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCKP06239 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCKP06239 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCKP06239 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCKP06239 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCKP06239 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCKP06239 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCKP06239 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCKP06239 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCKP06239 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCKP06239 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCKP06239 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCKP06239 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCKP06239 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCKP06239 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCKP06239 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCKP06239 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCKP06239 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCKP06239 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCKP06239 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCKP06239 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCKP06239 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCKP06239 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCKP06239 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCKP06239 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCKP06239 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCKP06239 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCKP06239 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCKP06239 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCKP06239 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCKP06239 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCKP06239 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCKP06239 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms