Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFAP2AP05549 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAP2AP05549 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFAP2AP05549 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAP2AP05549 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms