Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1P04632 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1P04632 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1P04632 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1P04632 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1P04632 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1P04632 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1P04632 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1P04632 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1P04632 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1P04632 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms