Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DPB1P04440 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DPB1P04440 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPB1P04440 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DPB1P04440 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPB1P04440 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPB1P04440 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms