Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
EGFRP00533 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EGFRP00533 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EGFRP00533 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
EGFRP00533 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
EGFRP00533 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
EGFRP00533 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
EGFRP00533 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EGFRP00533 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
EGFRP00533 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
EGFRP00533 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
EGFRP00533 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
EGFRP00533 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
EGFRP00533 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
EGFRP00533 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
EGFRP00533 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EGFRP00533 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
EGFRP00533 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
EGFRP00533 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
EGFRP00533 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EGFRP00533 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EGFRP00533 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
EGFRP00533 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
EGFRP00533 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
EGFRP00533 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
EGFRP00533 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
EGFRP00533 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EGFRP00533 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
EGFRP00533 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
EGFRP00533 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
EGFRP00533 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
EGFRP00533 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
EGFRP00533 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EGFRP00533 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EGFRP00533 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
EGFRP00533 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
EGFRP00533 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EGFRP00533 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EGFRP00533 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
EGFRP00533 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
EGFRP00533 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
EGFRP00533 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
EGFRP00533 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EGFRP00533 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EGFRP00533 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EGFRP00533 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EGFRP00533 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EGFRP00533 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EGFRP00533 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EGFRP00533 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EGFRP00533 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
EGFRP00533 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EGFRP00533 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EGFRP00533 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EGFRP00533 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
EGFRP00533 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
EGFRP00533 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EGFRP00533 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EGFRP00533 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
EGFRP00533 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EGFRP00533 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
EGFRP00533 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EGFRP00533 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
EGFRP00533 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
EGFRP00533 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EGFRP00533 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EGFRP00533 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
EGFRP00533 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
EGFRP00533 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EGFRP00533 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
EGFRP00533 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EGFRP00533 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EGFRP00533 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EGFRP00533 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EGFRP00533 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EGFRP00533 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EGFRP00533 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EGFRP00533 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EGFRP00533 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EGFRP00533 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EGFRP00533 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
EGFRP00533 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EGFRP00533 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EGFRP00533 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EGFRP00533 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EGFRP00533 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EGFRP00533 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EGFRP00533 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms