Protein–RNA interactions for Protein: O95744

PMS2P2, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P2O95744 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms