Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPNE6O95741 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPNE6O95741 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPNE6O95741 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPNE6O95741 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms