Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZIC2O95409 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZIC2O95409 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZIC2O95409 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIC2O95409 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms