Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1O95273 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNDBP1O95273 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1O95273 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1O95273 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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