Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
USP19O94966 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
USP19O94966 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
USP19O94966 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
USP19O94966 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
USP19O94966 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
USP19O94966 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
USP19O94966 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
USP19O94966 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP19O94966 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP19O94966 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP19O94966 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP19O94966 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
USP19O94966 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
USP19O94966 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
USP19O94966 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
USP19O94966 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
USP19O94966 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
USP19O94966 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
USP19O94966 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
USP19O94966 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
USP19O94966 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
USP19O94966 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
USP19O94966 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
USP19O94966 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
USP19O94966 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
USP19O94966 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
USP19O94966 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
USP19O94966 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
USP19O94966 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
USP19O94966 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
USP19O94966 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
USP19O94966 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
USP19O94966 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
USP19O94966 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP19O94966 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP19O94966 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
USP19O94966 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
USP19O94966 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
USP19O94966 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
USP19O94966 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
USP19O94966 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP19O94966 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP19O94966 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP19O94966 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP19O94966 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP19O94966 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP19O94966 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
USP19O94966 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
USP19O94966 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
USP19O94966 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
USP19O94966 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
USP19O94966 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
USP19O94966 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
USP19O94966 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
USP19O94966 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
USP19O94966 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
USP19O94966 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
USP19O94966 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
USP19O94966 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
USP19O94966 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
USP19O94966 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
USP19O94966 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
USP19O94966 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
USP19O94966 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
USP19O94966 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP19O94966 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP19O94966 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
USP19O94966 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
USP19O94966 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP19O94966 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP19O94966 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP19O94966 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP19O94966 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP19O94966 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP19O94966 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP19O94966 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP19O94966 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP19O94966 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
USP19O94966 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
USP19O94966 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
USP19O94966 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
USP19O94966 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
USP19O94966 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
USP19O94966 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
USP19O94966 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
USP19O94966 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
USP19O94966 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
USP19O94966 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
USP19O94966 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
USP19O94966 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
USP19O94966 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
USP19O94966 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
USP19O94966 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
USP19O94966 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
USP19O94966 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
USP19O94966 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
USP19O94966 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
USP19O94966 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
USP19O94966 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms