Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUBNO60494 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUBNO60494 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUBNO60494 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUBNO60494 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUBNO60494 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUBNO60494 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUBNO60494 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUBNO60494 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUBNO60494 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUBNO60494 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUBNO60494 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUBNO60494 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUBNO60494 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUBNO60494 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUBNO60494 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUBNO60494 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUBNO60494 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CUBNO60494 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUBNO60494 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CUBNO60494 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUBNO60494 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUBNO60494 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUBNO60494 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUBNO60494 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUBNO60494 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUBNO60494 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUBNO60494 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUBNO60494 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUBNO60494 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUBNO60494 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUBNO60494 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUBNO60494 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUBNO60494 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUBNO60494 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUBNO60494 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUBNO60494 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUBNO60494 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUBNO60494 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUBNO60494 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUBNO60494 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUBNO60494 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUBNO60494 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUBNO60494 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUBNO60494 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUBNO60494 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUBNO60494 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUBNO60494 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUBNO60494 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CUBNO60494 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUBNO60494 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUBNO60494 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUBNO60494 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUBNO60494 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUBNO60494 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUBNO60494 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUBNO60494 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUBNO60494 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUBNO60494 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUBNO60494 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUBNO60494 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUBNO60494 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUBNO60494 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUBNO60494 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUBNO60494 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUBNO60494 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUBNO60494 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUBNO60494 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CUBNO60494 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CUBNO60494 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CUBNO60494 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CUBNO60494 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CUBNO60494 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUBNO60494 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUBNO60494 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CUBNO60494 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CUBNO60494 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CUBNO60494 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUBNO60494 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUBNO60494 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CUBNO60494 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUBNO60494 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUBNO60494 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUBNO60494 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUBNO60494 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUBNO60494 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUBNO60494 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUBNO60494 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CUBNO60494 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUBNO60494 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CUBNO60494 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUBNO60494 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CUBNO60494 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUBNO60494 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUBNO60494 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUBNO60494 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUBNO60494 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUBNO60494 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUBNO60494 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUBNO60494 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms