Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX5O60225 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX5O60225 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX5O60225 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX5O60225 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX5O60225 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX5O60225 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX5O60225 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX5O60225 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX5O60225 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX5O60225 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX5O60225 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX5O60225 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX5O60225 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX5O60225 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX5O60225 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX5O60225 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX5O60225 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX5O60225 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX5O60225 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX5O60225 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX5O60225 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX5O60225 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX5O60225 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX5O60225 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX5O60225 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX5O60225 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX5O60225 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX5O60225 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX5O60225 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX5O60225 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX5O60225 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX5O60225 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX5O60225 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX5O60225 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX5O60225 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX5O60225 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX5O60225 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX5O60225 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX5O60225 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX5O60225 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX5O60225 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX5O60225 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX5O60225 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX5O60225 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX5O60225 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX5O60225 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX5O60225 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX5O60225 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX5O60225 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX5O60225 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSX5O60225 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX5O60225 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX5O60225 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX5O60225 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX5O60225 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX5O60225 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX5O60225 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX5O60225 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX5O60225 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX5O60225 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX5O60225 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX5O60225 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX5O60225 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX5O60225 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX5O60225 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX5O60225 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX5O60225 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX5O60225 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX5O60225 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX5O60225 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX5O60225 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX5O60225 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX5O60225 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX5O60225 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX5O60225 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX5O60225 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX5O60225 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX5O60225 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSX5O60225 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSX5O60225 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX5O60225 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX5O60225 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX5O60225 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX5O60225 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX5O60225 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX5O60225 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX5O60225 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX5O60225 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX5O60225 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX5O60225 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX5O60225 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX5O60225 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX5O60225 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX5O60225 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX5O60225 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX5O60225 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX5O60225 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX5O60225 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX5O60225 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms