Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCEO43556 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCEO43556 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCEO43556 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCEO43556 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCEO43556 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCEO43556 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCEO43556 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCEO43556 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCEO43556 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCEO43556 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCEO43556 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCEO43556 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SGCEO43556 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCEO43556 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCEO43556 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCEO43556 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCEO43556 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCEO43556 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCEO43556 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCEO43556 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCEO43556 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCEO43556 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCEO43556 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCEO43556 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCEO43556 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCEO43556 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCEO43556 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCEO43556 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCEO43556 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCEO43556 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCEO43556 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCEO43556 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCEO43556 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCEO43556 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCEO43556 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCEO43556 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCEO43556 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCEO43556 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCEO43556 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCEO43556 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCEO43556 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCEO43556 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCEO43556 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCEO43556 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCEO43556 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCEO43556 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCEO43556 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCEO43556 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCEO43556 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCEO43556 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCEO43556 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCEO43556 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCEO43556 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCEO43556 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCEO43556 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCEO43556 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCEO43556 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCEO43556 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCEO43556 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCEO43556 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCEO43556 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCEO43556 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCEO43556 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCEO43556 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCEO43556 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCEO43556 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCEO43556 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCEO43556 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCEO43556 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCEO43556 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCEO43556 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCEO43556 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCEO43556 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCEO43556 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCEO43556 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCEO43556 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGCEO43556 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCEO43556 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCEO43556 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCEO43556 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCEO43556 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCEO43556 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCEO43556 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCEO43556 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCEO43556 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCEO43556 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCEO43556 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCEO43556 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCEO43556 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCEO43556 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCEO43556 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCEO43556 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCEO43556 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCEO43556 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCEO43556 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCEO43556 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCEO43556 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCEO43556 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCEO43556 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms