Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM1O43490 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM1O43490 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM1O43490 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM1O43490 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM1O43490 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM1O43490 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM1O43490 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM1O43490 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM1O43490 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM1O43490 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM1O43490 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM1O43490 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM1O43490 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM1O43490 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM1O43490 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM1O43490 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM1O43490 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM1O43490 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM1O43490 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM1O43490 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM1O43490 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM1O43490 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM1O43490 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM1O43490 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM1O43490 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM1O43490 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM1O43490 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM1O43490 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM1O43490 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM1O43490 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM1O43490 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM1O43490 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM1O43490 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM1O43490 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM1O43490 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM1O43490 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM1O43490 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM1O43490 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM1O43490 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM1O43490 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM1O43490 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM1O43490 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM1O43490 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM1O43490 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM1O43490 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM1O43490 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM1O43490 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM1O43490 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM1O43490 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM1O43490 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROM1O43490 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM1O43490 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM1O43490 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROM1O43490 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM1O43490 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM1O43490 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM1O43490 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM1O43490 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM1O43490 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM1O43490 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROM1O43490 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM1O43490 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM1O43490 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM1O43490 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM1O43490 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM1O43490 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROM1O43490 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROM1O43490 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROM1O43490 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROM1O43490 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROM1O43490 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROM1O43490 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROM1O43490 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROM1O43490 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROM1O43490 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PROM1O43490 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROM1O43490 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROM1O43490 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROM1O43490 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROM1O43490 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROM1O43490 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROM1O43490 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROM1O43490 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROM1O43490 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROM1O43490 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PROM1O43490 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROM1O43490 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROM1O43490 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROM1O43490 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROM1O43490 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROM1O43490 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROM1O43490 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROM1O43490 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROM1O43490 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROM1O43490 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROM1O43490 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROM1O43490 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROM1O43490 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROM1O43490 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms