Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF208O43345 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF208O43345 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF208O43345 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF208O43345 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms