Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
RGPD8O14715 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RGPD8O14715 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RGPD8O14715 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RGPD8O14715 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RGPD8O14715 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RGPD8O14715 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RGPD8O14715 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RGPD8O14715 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RGPD8O14715 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RGPD8O14715 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RGPD8O14715 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RGPD8O14715 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RGPD8O14715 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RGPD8O14715 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RGPD8O14715 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RGPD8O14715 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RGPD8O14715 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
RGPD8O14715 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RGPD8O14715 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RGPD8O14715 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RGPD8O14715 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RGPD8O14715 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RGPD8O14715 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RGPD8O14715 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RGPD8O14715 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RGPD8O14715 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RGPD8O14715 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
RGPD8O14715 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
RGPD8O14715 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
RGPD8O14715 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RGPD8O14715 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RGPD8O14715 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RGPD8O14715 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RGPD8O14715 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RGPD8O14715 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms