Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAFD1O14545 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRAFD1O14545 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAFD1O14545 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAFD1O14545 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAFD1O14545 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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