Protein–RNA interactions for Protein: O00182

LGALS9, Galectin-9, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9O00182 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LGALS9O00182 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LGALS9O00182 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGALS9O00182 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGALS9O00182 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGALS9O00182 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGALS9O00182 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGALS9O00182 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LGALS9O00182 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LGALS9O00182 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LGALS9O00182 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LGALS9O00182 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LGALS9O00182 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms