Protein–RNA interactions for Protein: O00178

GTPBP1, GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1O00178 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTPBP1O00178 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTPBP1O00178 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP1O00178 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTPBP1O00178 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTPBP1O00178 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTPBP1O00178 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms