Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3QRK9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3QRK9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QRK9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QRK9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QRK9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QRK9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QRK9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QRK9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3QRK9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
J3QRK9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3QRK9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3QRK9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3QRK9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3QRK9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3QRK9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
J3QRK9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
J3QRK9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
J3QRK9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3QRK9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3QRK9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3QRK9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3QRK9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3QRK9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3QRK9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
J3QRK9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
J3QRK9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
J3QRK9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3QRK9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3QRK9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3QRK9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3QRK9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3QRK9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
J3QRK9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3QRK9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3QRK9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3QRK9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3QRK9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3QRK9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3QRK9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3QRK9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3QRK9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
J3QRK9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
J3QRK9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
J3QRK9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3QRK9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3QRK9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3QRK9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3QRK9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
J3QRK9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3QRK9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3QRK9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3QRK9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3QRK9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3QRK9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3QRK9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3QRK9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3QRK9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3QRK9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3QRK9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3QRK9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
J3QRK9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
J3QRK9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
J3QRK9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QRK9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QRK9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QRK9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3QRK9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QRK9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QRK9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QRK9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QRK9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QRK9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QRK9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3QRK9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3QRK9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3QRK9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3QRK9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QRK9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QRK9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QRK9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QRK9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QRK9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QRK9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QRK9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QRK9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QRK9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QRK9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QRK9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QRK9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3QRK9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3QRK9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3QRK9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3QRK9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3QRK9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3QRK9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QRK9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QRK9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QRK9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3QRK9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms