Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN34H7C241 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN34H7C241 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN34H7C241 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms