Protein–RNA interactions for Protein: H3BSH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSH0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BSH0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BSH0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BSH0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3BSH0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3BSH0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BSH0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H3BSH0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
H3BSH0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H3BSH0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BSH0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BSH0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BSH0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BSH0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BSH0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BSH0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BSH0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BSH0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BSH0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BSH0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BSH0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BSH0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BSH0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BSH0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BSH0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BSH0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BSH0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BSH0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BSH0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BSH0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BSH0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BSH0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BSH0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BSH0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BSH0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BSH0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BSH0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BSH0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BSH0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BSH0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BSH0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BSH0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BSH0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BSH0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BSH0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BSH0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BSH0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BSH0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BSH0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSH0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSH0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSH0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSH0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSH0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSH0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSH0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSH0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSH0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSH0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSH0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSH0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSH0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSH0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BSH0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BSH0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BSH0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BSH0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BSH0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BSH0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BSH0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSH0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSH0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BSH0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BSH0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSH0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSH0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSH0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSH0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BSH0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSH0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSH0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSH0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSH0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSH0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSH0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSH0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSH0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSH0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSH0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSH0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSH0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSH0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSH0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSH0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSH0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSH0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSH0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSH0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSH0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSH0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms