Protein–RNA interactions for Protein: H3BSA7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSA7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BSA7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BSA7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BSA7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BSA7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BSA7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BSA7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BSA7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BSA7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BSA7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BSA7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BSA7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BSA7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BSA7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BSA7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BSA7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BSA7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BSA7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BSA7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BSA7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BSA7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BSA7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BSA7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BSA7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BSA7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BSA7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BSA7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BSA7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BSA7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BSA7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BSA7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BSA7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BSA7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BSA7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BSA7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BSA7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BSA7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BSA7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BSA7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BSA7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BSA7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BSA7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BSA7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BSA7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BSA7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BSA7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BSA7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BSA7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BSA7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BSA7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BSA7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BSA7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BSA7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BSA7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BSA7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BSA7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BSA7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BSA7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BSA7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BSA7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BSA7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BSA7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BSA7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BSA7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BSA7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H3BSA7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BSA7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BSA7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BSA7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BSA7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BSA7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BSA7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BSA7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BSA7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BSA7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BSA7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BSA7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BSA7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BSA7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BSA7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BSA7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BSA7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BSA7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BSA7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BSA7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BSA7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BSA7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BSA7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BSA7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BSA7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BSA7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BSA7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BSA7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BSA7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BSA7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BSA7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BSA7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BSA7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BSA7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BSA7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms