Protein–RNA interactions for Protein: H3BR10

SMLR1, Small leucine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMLR1H3BR10 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMLR1H3BR10 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMLR1H3BR10 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMLR1H3BR10 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMLR1H3BR10 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMLR1H3BR10 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMLR1H3BR10 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMLR1H3BR10 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMLR1H3BR10 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMLR1H3BR10 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms