Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227AF5H4B4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM227AF5H4B4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM227AF5H4B4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227AF5H4B4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227AF5H4B4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms