Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4EB2RXH2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4EB2RXH2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4EB2RXH2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4EB2RXH2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 528.2 ms