Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF25A6NGN4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF25A6NGN4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF25A6NGN4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF25A6NGN4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF25A6NGN4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms