Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP17L4A6NCW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP17L4A6NCW7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
USP17L4A6NCW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP17L4A6NCW7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP17L4A6NCW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP17L4A6NCW7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP17L4A6NCW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP17L4A6NCW7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP17L4A6NCW7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP17L4A6NCW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP17L4A6NCW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
USP17L4A6NCW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP17L4A6NCW7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP17L4A6NCW7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP17L4A6NCW7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP17L4A6NCW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP17L4A6NCW7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP17L4A6NCW7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP17L4A6NCW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP17L4A6NCW7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP17L4A6NCW7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP17L4A6NCW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
USP17L4A6NCW7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP17L4A6NCW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms