Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00862A6NCI5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00862A6NCI5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LINC00862A6NCI5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00862A6NCI5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00862A6NCI5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00862A6NCI5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms