Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPL8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPL8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PPL8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PPL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PPL8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1W2PPL8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPL8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms