Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVI7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVI7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
A0A1B0GVI7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GVI7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GVI7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVI7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVI7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVI7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVI7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVI7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVI7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVI7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVI7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVI7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms