Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A087WSZ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms